耳朵跟喉咙交界处很痛一吞口水就痛考虑是外伤、上呼吸道感染、中耳炎、扁桃体炎、急性咽喉炎等原因所造成的。
1、外伤：如果受到外伤，在吞咽时，也会感到不适。此时建议用碘伏消毒，然后用纱布包扎，促进伤口愈合。
2、上呼吸道感染：指的是发生在鼻腔、咽喉部位的急慢性炎症反应，由于咽喉、鼻腔等黏膜受到炎症的刺激，因此会引起疼痛、咳嗽、咳痰等不适症状，而吞咽口水时会牵拉到受损的黏膜。需要在医生的指导下规范性服用布洛芬片、对乙酰氨基酚片等消炎镇痛的药物进行治疗。
3、中耳炎：主要是细菌、病毒等病原体通过咽鼓管侵犯中耳黏膜所引起的炎症性疾病，可引起耳朵流脓、耳朵疼痛等症状，而疼痛症状严重时，可沿着神经向咽喉部位放射。需要及时用双氧水清洗耳道，之后使用糠酸莫米松滴耳液进行消炎治疗。
4、扁桃体炎：主要是病原微生物感染扁桃体隐窝所引起的疾病，可导致咽喉黏膜以及淋巴组织出现不同程度的炎症反应，会导致喉咙与耳朵交界部位出现疼痛，同时还会伴有咽喉疼痛、吞咽困难等其他表现。需要在医生的指导下规范性服用抗生素类的药物进行治疗，比如阿莫西林颗粒、头孢克肟胶囊、阿奇霉素分散片等。
5、急性咽喉炎：是咽喉黏膜、黏膜下组织和淋巴组织的急性炎症，通常由病毒或细菌感染引起，可表现为咽喉发痒、咳嗽，甚至可能导致声音沙哑，以及嗓子跟耳朵根连接处疼，吞咽很痛的现象。建议及时就诊，遵医嘱使用消炎药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、诺氟沙星胶囊等。
建议患者出现以上症状，应及时就医，明确病因，针对性治疗。