喉结右侧里面隐隐作痛通常与咽炎、扁桃体炎、甲状腺炎等原因有关，可明确原因后对因治疗。
1、咽炎：如果经常吸烟、饮酒或吃辛辣刺激食物以及长期接触粉尘等不良环境，均可诱发咽炎，当炎症累及在喉结右侧部位时，会表现为局部隐痛，并伴随咽部干燥、发痒、吞咽困难等不适。需要改善不良的进食习惯，并遵医嘱选用呋喃西林溶液、复方硼砂含漱液或生理盐水含漱，可促使炎症消失。
2、扁桃体炎：主要是由致病微生物感染而引起，典型症状表现为咽部不适、咽部疼痛、发热等不适。如果疼痛累及在右侧喉结部位，患者会感觉到局部隐痛。通常可遵医嘱选择阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢克肟片等药物进行抗炎治疗。
3、甲状腺炎：一般是细菌或真菌感染而导致，因炎症刺激可出现甲状腺不同程度的肿大，触摸起来有硬感，并伴随不同程度的疼痛。通常可遵医嘱选择注射用亚胺培南西司他丁钠、注射用氨曲南等药物，控制细菌、真菌感染，并配合盐酸多巴胺注射液，恢复维持血压。
除以上原因以外，也不排除是局部卡有异物或发生甲状腺结节而引起，需进一步去医院做详细检查来明确诊断。