眼睛磨的不舒服，需要根据引起的原因使用合适的滴眼液治疗，常见的因素包括视疲劳、过敏以及细菌感染。
1、视疲劳：如果是用眼过度导致的，可以适当休息，也可在医生的指导下使用抗疲劳的滴眼液，如七叶洋地黄双苷滴眼液、右旋糖酐羟丙甲纤维素滴眼液等。
2、过敏：如果属于过敏体质，当接触过敏原时，如动物毛发、尘螨等，就可刺激机体产生变态反应，引起眼部异物感、眼睛发痒、眼睛疼痛等症状。可给予抗过敏的滴眼液进行治疗，如盐酸氮卓斯汀滴眼液、萘敏维滴眼液、盐酸奥洛他定滴眼液等。
3、细菌感染：细菌感染后可能会造成结膜异常充血、肿胀，产生不适，可遵医嘱给予抗生素类药物治疗，如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、氯霉素滴眼液等。
此外，病毒感染结膜或角膜后，也可引起眼部肿胀、疼痛等不适，可在医生指导下给予抗病毒类滴眼液，如阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液、重组人干扰素α1b滴眼液等。