囊胚移植即胚胎移植，胚胎移植第十九天有褐色分泌物可能是先兆流产、移植失败、妇科炎症等导致的，需针对病因进行治疗。
1、先兆流产：胚胎移植后做了一些剧烈运动，或有营养不良、长时间情绪低落等不良行为，那么可能会导致先兆流产，出现阴道褐色分泌物、腹痛等症状。建议及时到医院行血HCG、彩超等检查，并遵医嘱进行保胎治疗，期间要多休息，保证营养摄入充足。
2、移植失败：胚胎移植后多种因素可影响胚胎的发育，如子宫内膜薄、精子质量差、女性内分泌失调等，可导致移植失败。建议入院就医，若经检查后确定胚胎已停止发育，建议尽快结束妊娠。
3、妇科炎症：患有阴道炎、外阴炎等妇科炎症，可能会出现阴道褐色分泌物、异味、外阴瘙痒等症状。建议孕妇就医明确具体病因，遵医嘱进行抗菌消炎治疗，治疗期间注意保持私处卫生。
胚胎移植第十九天有褐色分泌物还可能是宫外孕的表现。