两年吃三次避孕药一般情况下不会造成太大的影响，还需要结合自身的状况决定。避免长时间服用避孕药，也需要在医师指导下规范用药检查，对身体产生的一些副作用以及损伤。
避孕药属于是一种激素类的药物，如果长时间过量用药，可能会产生的分泌物调的症状发生，如果两年内服用三次紧急避孕药，间隔的时间比较长，药物在体内代谢比较快，不会对身体健康造成影响，但是两年之内服用紧急避孕药间隔的时间比较短，可能会表现出月经紊乱，以及月经周期延长，严重时还会对日后的受孕造成影响。
在生活中最好可以做好避孕措施，避免长时间服用避孕药会对身体造成影响。