虽然益母草颗粒和益母颗粒都含有益母草成份，都具有活血行气，调经止痛的功效，但它们也存在一些不同点。比如益母草颗粒是由益母草一种成份组成，成份很单一，其主治血瘀症。对功能失调性子宫出血、子宫复旧不全或药物流产后子宫出血等中医辨证。而益母颗粒是在益母草颗粒的基础上添加了活血行气药，比如当归、川芎、木香，增强了行血止痛的功效，临床上常用于瘀血阻滞所致的月经不调、痛经、产后瘀血腹痛等症状。
益母草颗粒是由益母草制成，益母草性味辛、苦、凉，归心、肝经。专入血分，最善活血化瘀，调经利水，具有活血调经的作用，常用于血瘀所致的月经不调症，经水量少症。而益母颗粒主要由益母草、当归、川芎、木香组成。益母草活血，祛瘀，调经，消水。治月经不调，瘀血腹痛，尿血，泻血，痈肿疮疡等。 当归、川芎补血活血，木香行气，止痛，健脾，消食。诸药合用，有活血调经，行气止痛之功效。临床上将其常用于气滞血瘀，月经不调，痛经，产后瘀血腹痛。