喉咙吞口水都痛，临床上常见的有急性咽炎、疱疹性咽峡炎、急性扁桃体炎、扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿等相关的疾病。这些疾病的主要发病部位在口咽部，常常累及扁桃体、咽后壁、舌根部等相关部位，因此常常会出现吞口水喉咙疼痛的症状。
一般来说，这些疾病都是属于轻症，且具有一定的自愈性。患者可以服用一些清热止痛的药物对症处理，比如口咽清丸。口咽清丸属于中成药，君药为儿茶，其作用为止痛止血，生肌敛疮，含服能够缓解口咽疼痛；臣药中有马槟榔、薄荷叶、山豆根，可以起到清热去火的功效，佐药为乌梅、诃子，能够起到生津止渴、利咽的功效，对口咽类疾病起到针对性治疗。
如果感染的症状比较严重，则需要视情况联合抗病毒、抗菌药等对症治疗，才能缓解患者吞口水都痛的情况。
如果疼痛的范围在下咽部，临床上多在喉结或者环状软骨等部位，如果排除外伤等病因，多提示有急性会厌炎。如果是急性会厌炎，临床上需要进行较大的抗炎治疗，同时配合激素治疗。