同房后第三天小腹隐痛有可能是宫颈炎导致，也可能是月经即将来临前的表现。
子宫颈通过阴道间接与外界相通，是预防阴道内病原体侵入子宫腔的重要屏障。而当女人经历分娩、流产或手术时，宫颈会打开，如果它受到损伤，从阴道里进来的病原体如葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、厌氧菌、淋病双球菌、结核杆菌、滴虫等就会从破损的地方进入宫颔深层，就可能会引起宫颈炎。此外，性生活不注意卫生清洁、性生活过频、长期接触化学物质和放射线也可以引起宫颈炎。当炎症扩散到盆腔，那么在同房后就会出现小腹隐痛的表现。可以采取局部治疗，但在治疗前需做宫颈刮片，以排除早期宫颈癌。可采取药物治疗，上药前清洗阴道，可用清水或新洁尔灭清洗，然后再阴道用药，可用氯已定栓、爱保疗栓剂等。
月经是指伴随卵巢周期性变化而出现的子宫内膜周期性脱落及出血。月经来临前雌激素和孕激素会有剧烈波幅的变化，这可能会导致小腹隐痛。这是正常的，一般不需要治疗，日常注意低盐、低蛋白饮食，及时补充蔬菜、水果、谷类食物及适量的维生素、矿物质，限制烟酒和咖啡的摄入，适当的锻炼，保持足够休息，放松心情，就可以缓解。