食管反流可以遵医嘱使用抑制胃酸和保护胃黏膜的药物，也可以使用促进胃动力助消化的药品。
1.抑制胃酸的药品：胃酸分泌过多是引起胃酸反流的基本因素，因此患者可以在医生的指导下适当服用药物减少胃酸分泌，比如H2受体阻滞剂。此外，患者还可以服用质子泵抑制剂，此药的抑酸作用比较好。患者在减少胃酸分泌后，可有效避免胃酸对食管黏膜的损伤，促进病变部位的愈合。
2.保护黏膜的药品：保护胃黏膜的药物可以有效增加黏膜的修复，主要是包括铝碳酸镁剂和枸橼酸铋剂，有利于受损的黏膜恢复，也可以减少食管反流，减轻局部的严重程度，控制病情的发展。
3.促进胃动力助消化的药品：主要是包括多潘立酮片和莫沙必利，可以有效的加速肠道的蠕动，排空胃部，改善胃部胀气或者消化不良等多种现象，但是需要在医生的指导下使用。
食管反流患者除了要遵医嘱进行药物治疗外，生活中还应减少每餐的进食量和脂肪的摄入量，不可以吃巧克力、太酸、太甜的食物。这些食物可以降低食管下括约肌的静息压力，扩张胃，从而增加反流的频率，饮食方面应以高蛋白、高纤维和低脂肪为基础。一些咖啡、浓茶、可乐、柑橘类饮料、番茄汁等都可刺激胃酸分泌，或因高渗压引起的反流症状，患者尽量少喝以上饮品。