治疗肌肉萎缩没有最好的药物，当出现肌肉萎缩时可以通过肌肉萎缩的类型来对症用药，肌肉萎缩分为肌源性肌肉萎缩、神经源性肌肉萎缩等。
1、肌源性肌肉萎缩：如果是由于肌炎或者营养不良等原因所引起的肌肉萎缩，可以在医生的指导下通过服用改善腺体功能或尝试肌苷片药物，比如B族维生素、艾地苯醌片、鼠神经生长因子等药物来进行治疗，从而使病情得到好转。
2、神经源性肌肉萎缩：如果是由于神经炎等原因所造成的肌肉萎缩，除了对症治疗外，可以在医生的指导下通过使用维生素类的药物来缓解病情，比如维生素B12、维生素B1等，以上药物可促进神经的再生以及腱鞘再生,可进一步改变神经萎缩的程度，或者服用一些改善线粒体功能的药物，比如艾地苯醌、丁苯酞等，也可以服用一些扩血管的药物，比如贝前列素、列地尔等，通过扩张血管后，能够有效的改善神经的营养状态，使病情有所好转。
治疗期间一定要注意多休息，放松心情，不要精神压力太大，饮食上可以多吃一些富含优质蛋白类的食物。