扁平疣好了体内可能还会有病毒，具体情况是因人而异的。
扁平疣好了，如果只是单纯的皮疹、疼痛等皮肤表面的症状好了，此时可能体内还会有病毒，当身体的免疫能力下降或者受到内、外因素的刺激时，有可能还会导致扁平疣复发。因此建议在扁平疣治疗好后，可以到当地正规的医院进行复查，明确体内病毒是否还有存活。如果有存活，需要彻底的进行抗病毒的治疗，直到将病毒杀死，才能够避免扁平疣的复发。
扁平疣是由于人感染了人乳头瘤病毒而引起的皮肤病，可以在医生的指导下，使用水杨酸、干扰素凝胶等药物进行外部涂抹，也可以选择进行激光冷冻治疗，效果也是比较不错的。另外平时要多注意锻炼身体，提高自身的免疫力，也可以遵医嘱服用胸腺五肽、香菇多糖等提高免疫力的药物来改善。
扁平疣的患者在日常的生活中要保持皮肤的干净清洁，避免与他人共用个人卫生用品，比如毛巾、衣物、被褥等，同时如果有瘙痒的症状要避免用手抓挠，以免抓破皮肤，给身体造成更严重的危害。