十二岁女孩脸上长痘痘首先要明确原因再对症处理，导致脸上长痘痘的原因，一般包括雄激素水平异常、炎症反应等。
1、雄激素水平异常：雄激素水平异常是内分泌细胞所产生一类可以起到高效能传递作用的化学物质，由于十二岁女孩临近青春期，身体内的雄激素很可能会出现增加的情况，从而使皮脂腺分泌也比较旺盛，因此脸部会出现长痘痘的情况。十二岁女孩的年龄比较小，一般不建议采用医美仪器去除，如果脸上痘痘不是特别严重，可以在生活和饮食方面进行调整，比如在饮食方面尽量以清淡、易消化食物为主，少吃辛辣和刺激性的食物，同时还要养成良好的生活习惯，不要熬夜，在外出时要做好防晒措施。必要时可以在医生的指导下使用阿达帕林凝胶等维甲酸类药物涂抹，可以有效改善脸部痘痘的症状。
2、炎症反应：十二岁女孩脸上长痘痘，还可能跟痤疮丙酸杆菌过度增生导致的炎症反应有一定的关系，痤疮丙酸杆菌能够促进角质层形成细胞、皮脂腺细胞受体表达，同时还可以水解皮质当中的甘油三酯，从而产生游离的脂肪酸，而游离脂肪刺激毛囊周围从而发生炎症，使局部出现痘痘、丘疹等。这种情况可以在医生的建议下使用过氧苯甲酰或者联合青霉素、红霉素等抗生素的药物进行治疗。