胎停绒毛检测能测出可能是由于胎儿染色体异常而导致的胎停育，也可能检测出胎儿并不是因为遗传病而导致的胎停育。
临床上导致胎停育的原因很多，常见的有以下几个方面：
一、胚胎因素。胚胎或胎儿染色体异常是早期流产最常见的原因，约占50%～60%。多发生在有家族遗传病史，高龄妊娠的夫妻身上。因为染色体的异常缺失、倒置、平衡易位等，在形成受精卵染色体进行匹配时容易出问题，导致胚胎不能正常发育，出现流产、胎停育、畸形儿等。
二、母体因素
（1）子宫异常：子宫是受精卵着床，胚胎发育的重要场所。若是内膜容受性不好，受精卵容易着床不稳而发生流产。子宫畸形、子宫疾病(如黏膜下肌瘤及某些肌壁间肌瘤、子宫腺肌病、宫腔粘连)、宫颈机能不全等。
（2）疾病感染：母体感染风疹、生殖道疱疹、巨细胞病毒等疾病。
（3）全身性疾病：母体患有严重感染、高热、心肝肾功能不全、严重贫血等疾病均可导致胚胎流产。
（4）内分泌异常：比如黄体功能不全、高催乳素血症、多囊卵巢综合征、甲减、糖尿病血糖控制不佳等均可能导致胎停育。
（5）免疫因素：若女性自身存在免疫疾病，例如系统性红斑狼疮、抗绒毛膜促性腺激素抗体、抗卵巢抗体以及抗子宫内膜抗体等病症，则孕育过程中就有可能引发胎停育。
三、环境因素。比如过多接触放射线和砷、铅、甲醛、苯、氯丁二烯等化学物质，均可能引起胎停育。