孕5周左侧腹部隐隐作痛可能是由于腹部遭受到撞击、过度紧张以及病毒感染因素引起的先兆流产，需要及时到医院做检查，然后给予后续药物治疗。
1、腹部遭受到撞击：孕5周属于早孕阶段，胎儿会进入到胚胎期，同时神经管也开始发育，但是胚胎并不是特别的牢固，如果在工作或者是行走的时候不小心撞到腹部会导致腹部受到影响，甚至还会导致胚胎动荡，从而引起腹部隐隐作痛的现象，需要适当的卧床休息，有利于症状的减轻。
2、过度紧张：孕5周女性会在这一周等不到月经发现自身怀孕而产生不同的心理因素，特别是出现恐惧心理之后怀疑胎儿发育不好或者是出现畸形儿过度的紧张情绪，会导致体内的内分泌功能受到影响，严重时还会促使激素含量释放量减低，从而引起腹部疼痛，需要适当的放松心情，必要时可以通过服用地屈孕酮药物补充激素，可以避免疼痛加重。
3、病毒感染：孕5周如果自身抵抗力降低没有做好防护，出现了风疹病毒以及单纯疱疹病毒感染之后，虽然对本身的影响不大，但是会感染到胚胎，导致腹部出现隐痛，需要及时到医院做检查，然后在医师指导下服用阿昔洛韦抗病毒药物治疗。