阴囊隐隐作痛可能是慢性前列腺炎、附睾炎、睾丸外伤、精索静脉曲张等原因引起的，建议及时到医院就诊，明确引起疼痛的原因，并在医生的指导下采取相应的治疗。
1、慢性前列腺炎：慢性前列腺炎的患者通常由于炎症的刺激会导致前列腺部尿道粘膜水肿，进而波及射精管的开口引起输精管炎症，导致患者出现阴囊部位隐隐作痛的症状。可在医生的指导下使用抗生素来控制感染，比如阿莫西林、阿司匹林等。
2、附睾炎：当患者出现急性或慢性附睾炎时，可能会出现附睾的肿大，从而使阴囊部位出现疼痛的症状。可以遵医嘱使用米诺环素、多西环素等药物来进行治疗。
3、睾丸外伤：如果睾丸受到外伤就会导致阴囊部位出现疼痛的症状，因为睾丸位于阴囊内，会牵扯到阴囊部位的神经，因此对于此种情况，应针对睾丸外伤进行治疗。待睾丸外伤恢复后，阴囊隐隐作痛症状一般即可缓解。
4、精索静脉曲张：如果阴囊内部精索发生静脉曲张，睾丸会因为局部的静脉充血而引起一定的阴囊隐隐作痛。如果病情比较轻微，可以采取热敷的方式来缓解，病情严重的应及时进行手术来改善。
由此可见，导致阴囊隐隐作痛的原因很多，建议患者出现这种情况，应及时查明原因，针对性进行治疗。