包茎手术后第三天更痛了，可能是生理现象引起的，还可能是出现了炎症感染导致的，具体的分析如下：
1、生理现象：患者在手术后出现这种症状，通常是由于手术创口刺激局部组织、神经从而诱发了疼痛的症状，这属于正常的生理现象，一般情况下是不需要治疗的。在此期间应注意休息，保持个人卫生即可；如果疼痛比较严重，建议在医生的指导下通过服用对乙酰氨基酚片、美洛昔康胶囊等止痛的药物进行治疗，同时要密切关注患者的病情状况，定期去医院复查。
2、炎症感染：包茎手术后患者如果护理不当、个人卫生不洁可能会导致局部出现细菌感染诱发炎症的情况，在临床通常会出现疼痛的症状，建议在医生的指导下，通过使用碘伏将局部彻底消毒，同时通过涂抹红霉素软膏等药物进行治疗，必要时口服罗红霉素分散片等消炎的药物进行缓解，防止感染进一步加重。
患者在手术后出现第3天更痛的情况，建议最好去医院进行检查，在医生的指导下进行科学规范治疗，同时应改掉不良的生活习惯，做好术后的护理，如有异常的症状，建议尽早干预治疗，避免影响患者的恢复。