智齿长出来一半，另一半被牙肉包着疼可以通过局部冲洗上药，也可以遵照医生的指导，通过口服消炎的药物治疗，严重者可以通过静脉输液治疗。
1、局部冲洗上药：智齿在生长的过程当中，牙肉包着明显的疼痛，可能是牙龈受到了刺激或者智齿不完全萌出的一种表现，可以到正规的医疗机构口腔科通过局部冲洗上药的方式治疗，主要利用双氧水冲洗，能达到比较好的消炎效果，及时达到减轻疼痛感。
2、口服消炎的药物：牙肉包着疼也有可能是牙龈发炎，根尖周炎的因素所引起，可以遵照医生的指导，通过口服消炎的药物进行治疗，比如通过口服阿莫西林胶囊和甲硝唑片。
3、静脉输液的方式治疗：智齿在生长的过程当中疼痛感比较严重者，有可能还会导致脸部有明显的疼痛感，并且会影响到正常的饮食。可以到正规的医疗机构，通过静脉输液的方式治疗，能达到比较好的抗炎效果，可以减轻牙齿疼痛的症状。
治疗期间也要做好口腔的清洁以及护理的工作，减少口腔部位受到不良的刺激，以免导致口腔的组织感染。