排卵后两天腰疼有可能是正常现象，也不排除是妇科疾病或者肾虚引起的腰疼。
1.正常现象：在排卵期出现腰疼，可能是由于卵泡从卵巢内部排出的时候，会在卵巢表面出现破损的症状，而且有可能会使卵泡内部的液体流出腹腔以及盆腔部位，如果身体比较敏感的情况下，有可能会出现腰疼的现象，如果腰疼不是特别厉害，属于是正常的生理现象。
2.妇科疾病：在排卵后出现腰疼的症状，也有可能是附件炎或者盆腔炎引起的。可是可以去正规医院做B超检查来明确病因，如果是炎症感染导致的，可以在医生的指导下服用消炎的药物，比如左氧氟沙星、阿莫西林、甲硝唑等药物进行消炎，如果疼痛特别明显的情况下，还可以通过止痛类的药物进行治疗，比如布洛芬颗粒等。
3.肾虚：如果身材偏瘦或者营养不良、气血不足的情况下出现腰疼的症状，也有可能是肾虚导致的，在肾虚的同时，可能还会伴有腰膝酸软的症状。可以在医生的指导下服用乌鸡白凤丸进行调理。
除上述原因之外，腰肌劳损、腰间椎盘突出症、坐骨神经痛等疾病也会引起上述症状。建议去正规医院做全面检查来明确病因。