HPV6阳性有疣体可以通过药物、手术以及物理治疗等方式治疗。
1.药物治疗:HPV6属于人乳头瘤病毒，可能会引起尖锐湿疣，患者可以到当地的医院进行正规的检查，确诊后可以在医生的指导下使用抗病毒、提高免疫力的药物进行抗治疗，常用药物包括维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特乳膏等。
2.手术治疗： HPV6感染引起尖锐湿疣之后，症状初期仅表现为红色或者灰色的丘疹状，随着感染情况的加剧或者时间的延长，感染面积就会增大，疣体数量还会增多，所以可以在医生的建议下进行手术治疗。
3.物理治疗:除了进行药物治疗或者手术治疗之外，可以采用电刀切除、二氧化碳激光疗法等方式进行物理治疗来消除尖锐湿疣。
患者无论采取哪种方式进行治疗，都要定期的到医院进行复查，另外在治疗期间要注意避免性生活，以免传染给配偶。另外需要加强体育锻炼，增强机体抗病毒的能力。在饮食上要注意多吃一些高蛋白和高纤维的食物，注意清淡饮食，避免吃一些辛辣油腻刺激性的食物，要多加注意休息，避免过度劳累。