肠气囊肿怎么治疗，需根据患者的实际情况而定。如果是症状不明显的或者是没有症状的肠气囊肿患者，可不用采取特殊治疗措施，临床观察即可，部分人群有可能囊肿会自行消失。
如果是有症状的肠气囊肿患者，比如患者感到明显的腹部不适、腹胀、腹泻等，这时就可采取一些相应的措施，以缓解患者的临床不适症状，如常规吸氧治疗。气囊内气体主要为非氧成分，是通过O2来置换患者肠壁囊腔内的H2、N2、CO2、甲烷或乙烷气体，随着囊腔内O2的吸收，囊腔会逐渐塌陷。目前临床比较常用的是面罩吸氧，而高压氧治疗由于需要专门的设备，导致使用起来不是很方便，所以使用相对比较少。
另外，如果肠气囊肿引起了肠梗阻，这时还可以在医生的指导下采取手术治疗，以缓解梗阻。如果肠气囊肿患者同时还存在幽门梗阻、炎症性肠道疾病、消化道恶性肿瘤等疾病，则针对肠气囊肿治疗的同时还需要同时治疗伴随疾病。
所以根据个体差异，其治疗的具体手段有一定的区别，还需由患者实际情况而定。建议患者要早发现早治疗。