肠镜一般情况下是不会把肠子戳破的。
肠镜检查属于一种比较常见的检查下消化道的方式，主要用来判断被检者的结肠黏膜、直肠黏膜等部位是否出现了病变。现在所使用的检查器械都属于纤维肠镜，质地相对比较柔软，而且也比较细，会通过被检查者的肛门插入到肠道内，这种检查方式相对比较安全，一般不会给肠道壁带来损伤，因此被检查者不需要过于担心。
在进行肠镜检查之前，被检查者需要将肠道的内容物彻底清理干净，多数被检查者需要服用轻泻剂，同时也需要大量的饮水来清洗肠道。等到出现了清水样的排泄物，说明肠道已经彻底清理干净，此时可以进行检查。
肠镜检查分为无痛肠镜和普通肠镜，无痛肠镜检查时会进行全身麻醉，整个手术的过程中不会感觉到明显的疼痛。而普通肠镜在插管时会出现便意增加的情况，有些被检查者还有可能会出现腹部胀痛的症状，但是大多数都可以忍受。
但在极个别特殊情况下，例如受检者本身存在肠道病变等，也有发生穿孔的风险。因此，做完检查之后需要时刻注意自身的变化情况，如果出现了明显的不适，比如持续性的腹泻、腹痛等，需要及时告知医生，以便及时采取相关的治疗方式。