临床上出现HPV高危型39阳性，建议到医院做进一步检查，比如宫颈tCT检查或者宫颈活检检查，根据检查结果制定合理的治疗方案。
如果只是单纯的HPV高危感染，可以使用干扰素治疗，患者治疗期间要提高机体免疫功能帮助病毒的清除。如果有宫颈细胞病变可以遵医嘱进行宫颈锥切。对于没有生育想法。年龄大的患者还可以行全子宫切除。
临床上HPV有多达几十种分型，不同的分型可以导致不同的疾病。根据HPV亚型、致病力大小或致癌危险性大小不同，可将HPV分为低危型和高危型两大类。
高危型HPV主要引起外生殖器癌、宫颈癌及高度外阴、宫颈上皮内瘤变及其他部位恶性病变等。型别有HPV16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73和82等。而HPV39，属于黏膜高危型，与宫颈癌、直肠癌、口腔癌、扁桃体癌等有关。
低危型HPV主要诱发外生殖器和皮肤的尖锐湿疣以及低度外阴、宫颈上皮内瘤变及其他部位的疣类病变和低度上皮内瘤变等。型别有HPV6、11、40、42、43、44、54、61、70、72、81和83等。