移植囊胚后肚子隐隐作痛不一定正常。
移植囊胚后下腹疼痛一般有两种情况，分别包括生理性腹痛和病理性腹痛，生理性属于正常，而病理性就属于不正常。
1、生理性腹痛：在胚胎移植成功后，肚子有一些轻微的不舒服，一般属于正常的生理现象，主要由宫缩导致。如果是在移植5天到6天，也有可能是胚胎着床引起的疼痛，少部分人还会有出血表现，此时一般不需要特殊的处理，但为了以防万一，也可以就医检查。
2、病理性腹痛：如果疼痛时间持续比较长，或者是逐渐加重，又或是伴有阴道流血，就不属于正常现象，需要即使就医，通过腹部彩超、血HCG等检查明确原因，再针对性的治疗，如果是宫腔受刺激，导致宫缩引起的，可以在医生的指导下服用抑制宫缩的药物进行缓解。如果此次胚胎移植失败，在进行下次移植时，除了孕激素保胎治疗，还要配合其他抑制宫缩的药物进行治疗。