扁平疣的去除方法有多种。由于多数扁平疣患者在发病后1～2年内能自行消退，因此对扁平疣的各种局部治疗的疗效评估应特别慎重，对一些能造成永久性瘢痕的疗法，尤其是脸部不宜使用。局部治疗3%酞丁胺霜、氟尿嘧啶软膏等点涂疣面、0.1%维A酸霜外用。对于数量较少的扁平疣患者，可选用冷冻、电灼或激光治疗，还可使用中医火针治疗。扁平疣不仅仅是自身传染，可以通过密切接触传染家人和朋友，这严重的威胁到患者的家人和朋友健康。
引起扁平疣的原因包括以下四点：
1、人类乳头瘤病毒扩散：扁平疣病毒是靠皮下毛细血管的流通来不断移动扩展的，导致扁平疣的传染，引发更多的扁平疣。
2、间接传染引起：通过污染物，如针、刷子、毛巾等间接传染。另外，外伤也是引起传染的重要因素。
3、风热邪毒侵入体内：多由肌肤腠理不密，风热邪毒侵入体内，或体内肝虚血燥，热毒外发郁积皮肤而发病。
4、免疫力低下：免疫力低下容易患者扁平疣，当自身抵抗力下降，就为扁平疣的产生创造了条件。