肛门镜检查主要应用于肛管以及直肠下段病变的检查，还可以借助肛门镜钳取上述部位病变的活组织标本，也可以通过肛门镜进行部分的治疗，不同类型以及不同型号的肛门镜，在临床应用中，它的用途也不一样，筒状肛门镜主要用于肛肠病的常规检查以及内痔等肛肠疾病的注射治疗等，在临床上用的比较多，其中圆筒肛门镜多用于检查，喇叭型肛门镜则用于治疗，分叶肛门镜主要用于肛瘘，肛周脓肿等疾病的检查和治疗，在临床上很多病人认为做肛门镜的时候比较不舒服，他会拒绝，其实一般都会建议患者出现肛肠科疾病时，建议做一个专科的肛门镜检查，但是如果有剧烈的疼痛，怀疑是肛裂时在临床上也不会用肛门镜去看，因为这样子的话会加重裂口的程度，还有肛周感染性疾病以及脓肿的情况，一般就是指诊后发现有明显的肛内有隆起或内口存在，也可以判断肛周脓肿的一般情况，也在手术过程中再去行肛门镜检查。

进行肠镜的检查，则需要术前做好肠道的清洁，比如灌肠或者是吃泻药，目的是排进直肠内所有的粪便，可以观察的范围是整个结肠，包括末端的回肠，可以发现这个范围之内，所有的占位性病变及直肠黏膜的状态，选择在无痛麻醉下进行。肛门镜比较短，只需要在局麻下甚至不用麻醉，可观察的范围主要以肛门周围的直肠黏膜为主，一般情况下患者痛苦比较小，检查前排净大便就可以。应该这样理解，肠镜的观察范围包括肛门镜的范围，而肛门镜的检查范围比较局限。

做完肠镜如果正常的话，一般来说是不需要再做肛门镜的检查，在肠镜下可以对肛管直肠进行观察，如果有担忧的话也可以考虑进一步做肛门镜的检查，肛门镜的检查是肛肠科常用的检查方式之一，相对来说操作起来也比较简单，主要就是了解肛管直肠的位置，有没有痔疮，肛裂，直肠发炎，肛窦发炎等疾病。在诊断明确以后，如果有痔疮或者是肛裂的话，可以先进行药物的保守治疗，必要的时候也可以通过手术进行治疗。

肛裂的临床检查手段在急性期时，不建议进行肠镜或肛门镜检查。如果患者感剧烈疼痛及极度不适，甚至出现休克的症状应及时停止检查，缓慢将直肠镜退出，不能暴力引镜或勉强坚持检查，以免造成不良后果。做肠镜一般镜头稍微比较粗，如果病情需要，肛裂的患者需要做肠镜应当慎重，应当在肠镜上面涂上润滑油，首先进行肛门按摩，食指扩肛使肛门括约肌松弛，防止镜头进入肛门容易使肛裂加重。