感染霉菌念珠菌可通过局部用药以及全身用药的方式彻底治疗，但是选择治疗方案时要以自己的具体情况为主，并且按疗程坚持用药，另外在治疗期间应避免性生活，以免交叉感染，反复发作。
1、局部用药：霉菌念珠菌通常是由于假丝酵母菌在自身免疫力下降之后，会侵犯到组织从而引起的炎症反应，同时还会分为单纯性外阴阴道假丝念珠菌病以及复杂性外阴阴道假丝念珠菌病，而对于单纯性外阴阴道假丝念珠菌病患者，可以通过局部应用克霉唑栓剂、米康唑栓剂或者是制菌霉素栓剂放置于阴道深部给药，可以促使症状好转。
2、全身用药：霉菌念珠菌会出现外阴阴道假丝念珠菌病，甚至还会导致患者出现复杂性外阴阴道假丝念珠菌病，在通过局部用药的时候，症状不是特别的显著，需要联合口服用药的方式给予治疗，其中包括氟康唑，如果患者的症状相对比较严重，就需要通过应用低浓度糖皮质激素药物治疗可以促使症状好转。
霉菌念珠菌用药治疗期间需要注意个人的卫生，同时还需要养成勤换内裤的习惯，而将换洗下来的内裤清洗之后，在太阳底下暴晒可以避免细菌滋生。