目前来说，对于导致不孕的原因和机制还不是十分清楚，但是研究发现，可能和以下几个方面有关。第一，盆腔内膜异位症，往往引起盆腔的重度的、广泛的粘连，而这种粘连导致盆腔解剖结构发生异常，从而影响到子宫、输卵管，卵巢等的功能，从而以导致不孕。第二，内膜异位症，因为内膜异位的存在，刺激腹膜可以发生一些炎性细胞因子的渗出、改变，从而整个盆腔的内环境发生改变，不利于生育。第三，免疫功能异常所导致的抗子宫内膜抗体的增加，引起子宫内膜代谢和功能受到破坏。第四，卵巢功能的异常，导致排卵障碍，或者黄体功能不全等等。另外子宫内膜异位症的女性，子宫内膜、子宫腔的内膜发育也不良，功能失调，也影响到胚胎的种植等等。

在女性的生理周期中，随着雌激素水平的升高，意味着子宫内膜增生、肿胀，如果再受到孕激素的影响，发生撤退性的出血，可以刺激局部组织，以至于出现疼痛。而对于子宫腺肌症的患者来说，因为出血是发生在子宫肌层之间，不能够顺畅的排出来，可以刺激子宫肌肉发生痉挛性的收缩，痛经更为显着。月经过去以后，异位的子宫内膜随着激素水平的改变，也逐渐的发生萎缩，痛经就会慢慢的缓解，到了下次月经，还会再次发生疼痛。那么子宫内膜异位症所引起来的痛经，往往是一种继发性的，在早期没有，往往在育龄期以后出现一个继发性的改变，早期发病的疼痛也不明显，但是随着病情的逐步发展，出现痛经程度的加剧，持续时间的延长，可以发生在月经前，月经时以及月经后，甚至可以持续到整个月经周期，都不再发生缓解。

内膜异位症因为内分泌发生各种变化，以及和疾病所致的解剖改变，卵巢相关的一些病变，以及腹腔内环境的改变，和手术治疗、手术的干扰等等因素相关。所以对于内膜异位症，还是会对卵巢功能造成一定的影响的。药物治疗以后也会引起内分泌功能和卵巢功能的改变。内膜异位对卵巢功能所产生的影响表现在，第一个可以影响卵泡的生长，第二可以降低卵子的质量，第三可以造成颗粒细胞和合成甾体激素的一种缺陷，第四是黄素化未破裂，卵泡综合征，第五出现黄体功能的缺陷。

目前的研究发现，子宫内膜异位症的女性患者，基本上是没有治愈的可能的，并且如果不及时的接受相应的治疗，还会引发其他的一些病变。对于子宫内膜异位症早期的女性患者来说，可以通过药物的方法对疾病加以治疗。一般只要根据医嘱去使用药物，就能够延缓病情的进展。子宫内膜异位症本身并不是一种肿瘤，绝大部分是一种良性的病变，但是临床行为和表现却像恶性肿瘤一样也会发生增生、浸润，扩散甚至转异，所以又称为良性癌，之所以称为良性癌，就是一个良性的疾病，但是又具有恶性肿瘤的一些表现，可以出现转异，出现疼痛等等，甚至可以导致育龄妇女出现一系列的临床表现。子宫内膜异位症病灶生长是比较缓慢的，随着月经每次的来潮，逐年逐月出现一个进行性加重。妊娠期因为体内有雌激素和孕激素水平比较高，低位的内膜可以发生退行性变，一直到绝经以后停止发展，所以一般对于内膜异位症来说，预后还是比较好的，只有极少数的异位子宫内膜可以发生癌变，但是这种癌变多数是发生在绝经以后的内膜异位症的患者。

腹腔镜检查是目前国际上公认的子宫内膜异位症诊断的最佳的方法。腹腔镜检查是确诊盆腔子宫内膜异位症的金标准。对于轻度和中度的内膜异位症患者，或者怀疑有内膜异位症，同时有合并有不孕的患者，以及慢性盆腔痛的患者，都可以通过做一些相应的妇科检查，如果触摸到有触疼的结节，或者B超即便检查出来没有阳性的体征，也可以考虑做腹腔镜的检查确诊作为一个首选。因为内膜异位症的患者，其中50%是可以导致不孕的，有些人在不孕患者中间，有相当一部分是因为内膜异位症所引起来的不孕，所以如果有内膜异位症的有不孕的患者，要做相关的一些其他有关生育的检查，如果其他检查都是正常的，没有找到不孕的原因，就要尽早来做腹腔镜，甚至是宫腔镜和腹腔镜联合来进行探查。