目前直肠癌治疗仍是以手术为主，同时辅以中药治疗的综合治疗方法，约有半数的直肠癌患者进行手术治疗，死亡原因是术后转移及复发，直肠癌治疗方法既包括传统的西医手术、放化疗及中医对证治疗，又包括新兴的分子靶向治疗与基因治疗等，采用中药、放化疗等坚持术后巩固治疗能明显降低术后死亡率，新兴的直肠癌治疗方法可在传统方法无效情况下使用，也可与传统方法联合使用，下面综述如下
1、直肠癌手术治疗
直肠癌手术治疗是首先强调手术切除，并注重联合术前化疗、放疗、中药等综合治疗以提高手术切除率，降低手术后复发率，提高生存率。直肠癌手术治疗的原则是:(1)尽量根治;(2)尽量保护盆腔植物神经，保存患者的性功能、排尿功能和排便功能，尽量保肛，提高生存质量。
结直肠癌肝转移的外科治疗，结直肠癌肝转移灶手术切除效果尚可，许多研究己证实其5年生存率为25%～35%，其10年生存率也达20%，总的中位生存时间28～40个月，肝转移灶切除后复发的患者，可再次手术。研究报道64例，再次手术后5年生存率为41%。因此除非存在绝对禁忌证，所有结直肠癌肝转移的患者，只要转移灶可以切除，都应考虑手术。对于肝转移灶不能切除的患者，或主瘤切除后切缘有残留或残留较多小癌灶，可采用中药、冷冻、射频、经肝动脉灌注化疗等治疗，可使一部分不能切除的患者转为可切除治疗。
2、直肠癌化疗
直肠癌约半数患者在术后出现转移和复发，除部分早期患者外，晚期和手术切除后的患者均需接受化疗。化疗在结直肠癌综合治疗中是除外科治疗后又一重要治疗措施。
全身静脉联合化疗方案直肠癌化疗方案主要以5-FU为基础，四氢叶酸(LV)作为调节剂可增强效应剂5-FU的疗效。5-FU/LV联合用药其疗效已被多数研究所证实，是现阶段世界范围内的标准疗法。
3、直肠癌放射治疗
仅适用于直肠癌中的直肠癌。术前放疗因未遭手术破坏，局部血供及含氧条件较好，造成医源性扩散或转移的机会亦小，故而认为术前放疗更加有利，可以起到降期和减少术中出血的作用。术后放疗由于分期合理，从而使术后放疗更有选择性，减少于术前放疗的盲目性和治疗负荷。
4、生物及免疫治疗
生物治疗就是通过从体外补充、诱导或活化体内本来固有的生物反应调节系统的具有细胞活性和(或)因子，以调节这种反应。有许多学者报道了肿瘤浸润淋巴细胞(tu-mor-infiltratinglymphocytes，TIL)可在体外从肿瘤中分离出来，培养扩增，并且有体外特异性杀伤作用。白细胞介素-2(IL-2)能解除TIL的无能状态，并能促进抗原提呈及T细胞反应。化疗能提高TIL向肿瘤部位聚集的导向性，增加TIL对肿瘤细胞的杀伤性。周庆贤等报道54例DukesC期直肠癌患者，行根治术后，采用前瞻性随机分组的方法，使用TIL免疫治疗加化疗于直肠癌术后患者，另一组采用相同的化疗方案为对照组。结果发现使用TIL后，免疫功能比对照组明显改善(P<0.05)，3年生存率高于对照组，但差异无显著性(P>0.05)。3年内局部复发率明显降低(P<0.05)。本研究结果提示中晚期直肠癌患者行根治术后，使用TIL免疫治疗是有效的，可望成为中晚期直肠癌患者术后重要的治疗方法。
5、基因治疗
所谓肿瘤基因治疗就是应用基因工程的方法校正或修复与肿瘤发生有关的变异基因，或通过改变某些细胞的生物学特性，增强宿主的抗病能力，从而达到治疗肿瘤目的的一类方法。直肠癌的发生是由多种遗传和环境因素相互作用的结果。针对直肠癌的基因治疗有许多方法。总结起来可分为以下4类:(1)自杀基因治疗;(2)针对原癌基因和抑癌基因的治疗;(3)免疫基因治疗;(4)多种基因联合治疗。
直肠癌治疗虽已取得一定进展，但如何将各种治疗手段有机地结合，提高治愈率，减少并发症及副作用还需根据具体情况而定。