头痛的发病机制比较复杂，主要是由于颅内、颅外，痛敏结构内的痛觉感受器受到刺激，经痛觉传导通路，传达到大脑皮层而引起的，颅内痛敏结构包括静脉窦，脑膜前动脉及中动脉，颅底硬脑膜，三叉神经、舌咽神经、迷走神经等，颅外痛敏结构包括颅骨骨膜，头部皮肤、皮下组织、帽状腱膜，还有头颈部肌肉和颅外动脉，鼻窦、口咽部位和鼻黏膜等。还有一些机械、化学、生物刺激，和体内生化改变作用于颅内，颅外痛敏结构均可引起头痛。
头痛的发病机制比较复杂，主要是由于颅内、颅外，痛敏结构内的痛觉感受器受到刺激，经痛觉传导通路，传达到大脑皮层而引起的，颅内痛敏结构包括静脉窦，脑膜前动脉及中动脉，颅底硬脑膜，三叉神经、舌咽神经、迷走神经等，颅外痛敏结构包括颅骨骨膜，头部皮肤、皮下组织、帽状腱膜，还有头颈部肌肉和颅外动脉，鼻窦、口咽部位和鼻黏膜等。还有一些机械、化学、生物刺激，和体内生化改变作用于颅内，颅外痛敏结构均可引起头痛。
运动障碍疾病的发病机制并不是特别清楚。 目前认为是由于基底节区功能紊乱引起来的。基底节区的功能主要涉及到传入结构，是指壳核，还有传出结构，指丘脑的外侧部，丘脑的内侧部，黑质网状布，这两个结构之间功能出现了紊乱。这两个结构之间有两个通路，一个叫直接通路，一个叫间接通路，这两条通路是始发地和团的壳核，直接通过的话是通过一个单突触投射到苍白球的内侧部，以及黑质的复合体的运动部分。 间接通路是壳核经过丘脑的苍白球的外侧部到丘脑地核和丘脑的内侧部以及苍白球的内侧部，以及黑质的复合体通路。 直接和间接通路的神经传导受到了多巴胺黑质纹状体投射纤维的控制，多巴胺对于直接通路，具有兴奋的作用，同时可以抑制人间接通过到活动。
血管性疾病的发病机制是指由于脑血管发生某种病变，比如说脑血管发生了一个缺血使得他所供应脑细胞发生了一个坏死。第二个方面，血液从血管内流出来，跑到血管外，就叫脑出血。脑出血发生以后，它也会损害脑细胞，导致血管性痴呆的发生。从生物化学的角度来说不管是缺血还是出血，发生了以后导致脑细胞的损害。
牙髓因病原刺激物的不同作用以及机体抵抗力的差异，出现不同的病理变化。当牙齿受到取病、磨损、创伤或医源性因素等破坏牙釉质或牙骨质的完整性时，牙本质甚至牙髓会暴露于口腔而导致牙髓感染。侵入牙髓的细菌多，可产生多种有害物质，可直接毒害组织细胞或引发非特异性的炎症反应，直接导致组织损伤。牙髓受到刺激后出现血管扩张、血液充盈。由于牙髓组织处于四壁坚硬，缺乏弹性组织的牙髓腔内，其血液循环只能通过细小的根尖孔缺乏侧枝循环，一旦牙髓发生炎症，炎性渗出物不易引流。髓腔内组织压很快增高会产生剧烈的疼痛。
梅毒感染的发病机制如下： 外生殖器部位因为存在微小的裂隙，由于接触的对方是梅毒患者，他的梅毒螺旋体可通过这些微小的裂隙感染人体。当然通过接吻，也是可以感染梅毒螺旋体的，因为梅毒螺旋体可通过口腔微小的裂隙感染人体。梅毒感染起初是皮肤局部的损害，随后梅毒螺旋体在局部繁殖，通过淋巴结淋巴管扩散，甚至血液的播散，形成二期梅毒，这时候在人体的皮肤上就可以出现二期的玫瑰疹，如果不能及时治疗，它会进一步发展形成三期梅毒。
代谢综合征的发病机制，第一条就是脂肪以及代谢功能的异常。第二个环境，包括人群活动量的减少、饮食结构的异常，现在人的饮食结构都以脂肪、蛋白质的食物为主，碳水化合物其实进食的量也不是很少，相对来说维生素、矿物质要少一些，饮食结构的异常也是发病原因之一。第三个就是胰岛素抵抗，胰岛素抵抗最常见的原因，胰岛素抵抗可以诱发糖尿病，间接的引起脂代谢的异常。
