目前来说自闭症病因不是十分明了，大多数学者与专家认为可能与以下几种因素有关：
一、与遗传因素有关，最有名的就是双生子及双胞胎的研究，如果是单卵双生，他们的同病率，即两个患儿同时患自闭症的概率可达到82%。如是双卵双生，即两个双胞胎性别不一样或长相差别很多的，同病率可达10%。所以现在认为自闭症与遗传有很大的关系。
二、与围产期的高危因素有关，比如在围产期就怀孕或出生时有感染，如巨细胞病毒或弓形体感染，或存在早产的因素，这些孩子发生自闭症的几率会增高。
三、与神经系统发育有关，如进行功能性磁共振检查，可发现自闭症孩子的大脑某功能区发育不是很好，如额叶、颞叶或杏仁核、海马回等大脑的边缘系统，即人类情绪有关的发展区域有关。
目前来说自闭症病因不是十分明了，大多数学者与专家认为可能与以下几种因素有关： 一、与遗传因素有关，最有名的就是双生子及双胞胎的研究，如果是单卵双生，他们的同病率，即两个患儿同时患自闭症的概率可达到82%。如是双卵双生，即两个双胞胎性别不一样或长相差别很多的，同病率可达10%。所以现在认为自闭症与遗传有很大的关系。 二、与围产期的高危因素有关，比如在围产期就怀孕或出生时有感染，如巨细胞病毒或弓形体感染，或存在早产的因素，这些孩子发生自闭症的几率会增高。 三、与神经系统发育有关，如进行功能性磁共振检查，可发现自闭症孩子的大脑某功能区发育不是很好，如额叶、颞叶或杏仁核、海马回等大脑的边缘系统，即人类情绪有关的发展区域有关。
自闭症儿童有心理障碍。 自闭症是一种神经发育障碍性疾病，常伴有心理发育障碍，但其不是一种心理疾病。 如果患有自闭症，对这些孩子的未来，会带来极大的危害，如果家长忽略了早期儿童的异常行为表现，就会造成这些孩子严重的后果，如果发现孩子有自闭的风险，就有必要进行早期的心理治疗，发掘孩子的兴趣和爱好，增强孩子的社会技能，对于自闭症患儿的优点以及兴趣，要及时地发现并且加强，激发孩子的兴趣，不仅能够提高他们的行为能力，同时有可能让他们掌握生活和工作的技巧。
关于儿童为什么会患自闭症？有一个理论叫冰箱理论，这个理论曾经让很多父母很多年轻的父母都很伤心很难过、自责，孩子之所以会得自闭症是因为家长对孩子的冷漠。冷漠就是不管他让他自己呆着在感情上没有过多的付出，对一个孩子就像把孩子搁在一个冰箱里面一样，所以孩子会得自闭症。但其实这是一个非常错误的看法，其实这跟父母没不是说因为父母的原因导致孩子得自闭症的，家长尤其不要去当医生诊断孩子是得了自闭症得了孤独症而自责，觉得是因为自己的养育出了问题。其实关于这个疾病它现在确切的病因并不是很清楚，跟遗传因素、环境因素都有很大关系，因为它是一个发育性的疾病，所有神经发育性的疾病其实跟遗传因素都有很大关系。这是我们没有办法去改变的，因为基因它自从有了受精卵以后，他的基因就已经定在那里了。不要因为说孩子出现这种病就怪家长，现在确切的病因不是很清楚，有研究认为它跟缺乏什么维生素各种都是可能或许会有联系，这需要去做大量的科研来去证实它，但是现在目前它确切的病因并不是很清楚的。
自闭症男孩比女孩多，自闭症男女患病的一个比例为4:1。有的国家甚至高达8:1，尤其在高功能自闭症这一个患病当中，这种性别的差距就更为明显。自闭症发病率男孩高于女孩的原因，目前尚未完全明确，可能与女孩他的一个社会交往功能有优势，有关系。多数学者认为自闭症是一种多基因遗传性疾病，男孩的染色体是xy、而女孩的染色体是xx，而自闭症的易感基因很多都集中在y上。所以男孩一换致病病症，这种概率大大要高于女孩。呈现男孩较多的现象。另外一种说法，男孩可能更容易患上自闭症与基因激素有关，也可能与脑部结构的方式不同，也有关系。
和遗传基因有一定关系，男性的遗传基因更容易出现突变的可能性。自闭症男孩多，就是因为他X加Y染色体，Y上的基因发生了一些突变。 Y上的基因突变的原因目前没有一个肯定的答复，可能与生物的原因、环境的原因，还有就是遗传的原因都有一些关系。所以说自闭症男孩多一些，女孩要少一些。
自闭症的形成是由多种原因导致，具体如下： 一、家庭因素，父母与孩子沟通过少，对孩子冷漠或顽固，家庭缺乏温暖。 二、脑器质性损害，如产伤、宫内窒息、感染、中毒等，15%~50%的患儿伴有癫痫发作，脑电图异常、脑CT、核磁共振有非特异性改变，有的还伴有神经系统的体征。 三、先天风疹病毒感染，巨细胞病毒感染均可能与自闭症的发病有关。 四、环境因素，早年生活环境中缺乏丰富和适当的刺激，没有适应社会的行为能力，或长期处在单调环境中的孩子，会用反复动作来进行自我刺激，对外界环境缺乏爱好。
