山西医科大学口腔医学系始建于1983年，山西医科大学口腔医院以山西医科大学口腔医学系为依托，由原口腔医学系的口腔门诊发展而来，于1997年4月20日正式开展临床诊疗工作。
1998年4月20日，山西医科大学口腔医院正式挂牌成立。现下设牙周粘膜病科、牙体牙髓科、口腔综合科、口腔修复科、口腔正畸科、口腔颌面外科、口腔种植科7个临床科室，消毒供应室、影像科、药剂科、检验科4个临床辅助科室和院办、教学办、人事科、财务科、党务宣传科、设备材料科、医务科、院感科、总务基建科、门诊办、护理部11个职能科室。系院设有5个专业教研室，即口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复、口腔正畸、口腔基础五个教研室，4个口腔综合实验室，包括2个临床模拟实验室、1个口腔基础实验室和1个研究生实验室。5个教研室共承担18门口腔专业课的教学任务、前期实习和临床实习工作。即口腔内科教研室承担牙体牙髓病学、牙周病学、口腔粘膜病学、儿童牙病学、口腔预防医学、口腔医学导论等6门教学任务，口腔颌面外科教研室承担口腔颌面外科学、口腔放射诊断学的教学任务，口腔正畸教研室承担口腔正畸学、口腔医学美学、口腔解剖生理学的教学任务，口腔修复学教研室承担口腔修复学、口腔材料学、牙合学的教学任务，口腔基础教研室承担口腔组织病理学、口腔生物学、口腔临床药物学、口腔行为医学4门教学任务。
医院拥有一批技艺精湛的专家、教授和一大批获得突出成就的中青年医学骨干。现有教职员工176人，其中高级职称32人，博士11人，硕士40人，硕士生导师26人，教师队伍的平均年龄为39.4岁，具有硕士以上学位的教师人数占所有教师比例的72.3％。同时，我系（院）根据山西省高等学校“131”领军人才工程项目柔性引进中国工程院院士1人、长江学者1人，山西省“百人计划”入选者1人。
医院始终以教学工作为依托，大力开展医疗工作，对各种口腔类疾病的诊治达到较高水平。医院建筑面积5786.59平方米，现有多功能口腔综合治疗台74张，口腔病房床位30张，现有头颅CT机1台，数字化曲面断层X光机1台，数字化X光牙片机1台，根管显微镜1台，激光治疗仪1台，德国进口KaVo（CAD\CAM）计算机辅助治疗系统1套，笑气吸入镇痛系统，意大利超声骨刀切割系统，研究级倒置荧光显微镜、美国赛默飞组织病理切片机、石蜡包埋机、全自动生化分析仪等一大批高精仪器设备，为医、教、研等各方面工作提供良好的平台。
医院为山西医科大学临床教学医院，担负大量医学生临床课授课任务和实习带教任务。目前口腔医学系已为社会培养口腔医学本科毕业生1000余人，硕士学位毕业生（含同等学历）266人。目前尚有406名本科生和113名硕士研究生在读。
口腔医学系现有科研人员35人，其中教授（或相当专业技术职务者）14人，副教授（或相当专业技术职务者）9人。具有博士学位人数5人，具有硕士学位人数17人，共占全部科研人员总数的63%。医院重视科学研究工作。先后承担国家、省市、学校的大量科研攻关课题，近年来共承担国家级科研项目3项，省市级科研项目50余项，可控科研经费285.6万元。近五年共发表论文共330余篇，其中学术刊物210余篇，SCI收录3篇；出版学术专著4部；共获得各类科研成果17项，其中山西省科技进步奖3项，省级科研论文2项，授权专利7项，省级科技成果鉴定5项。
