当女性的外生殖器出现炎症、感染时会有性交疼痛，但此时根本不应该进行性生活。在正常女性中出现性交疼痛的绝大多数原因是在女性尚未充分兴奋时就急于性生活。这可以说大部分是她的性伴侣的错。
要知道，平常女性的外生殖器是紧闭的，这样可以防止细菌、微生物进入阴道造成感染。只有在性生活时，当女性激发起充分的性兴奋时，大小阴唇大量充血、外展，阴道口外露，为性生活作好准备。更为关键的是，女性在充分的性兴奋时会有大量的腺体分泌及体液“漏出”，它们充满阴道及阴道口，它是极好的润滑剂，它能诱导阴茎进入阴道并使得坚硬的阴茎进入阴道时不致使柔软的阴道粘膜因强烈的磨擦而受到损伤。如果不了解这一生理特点，在女性未进入充分的性兴奋状态下就急于性交，就会因为阴道口未完全张开、阴道过于干燥，坚硬的阴茎强行插入而造成阴道粘膜的磨擦、损伤、出现性交疼痛，严重的更会造成阴道撕裂、出血。在这种情况下，女性是不可能体验到性高潮的，她们能感觉到的只能是疼痛和伤害。
初次体验性生活的女性常常因为过于紧张而难以达到足够的性兴奋，换句话说，她的阴道往往并没有为性生活做好充分准备，甚至一些女性会因为对性交的恐惧而出现阴道痉挛。如果她的性伴侣也是经验不足的话，就很容易因为阴茎的强行插入而造成阴道粘膜的磨擦、损伤出现疼痛。一般来说，经过一定次数的性生活体验、积累了一定的性生活经验后这种情况就会改善或消失。如果有较多性生活经验，仍然在每次性生活都觉得疼痛的话就要考虑其它原因了。
少数的女性性交疼痛即可能是由于处女膜坚韧或闭锁，或外伤、手术、分娩后形成疤痕，阴道缩窄。极少数是由于先天阴道畸型、无阴道等而引起的。而现代医学在治疗上述的病例时可以说易如反掌，只需做简单的疤痕松解、手术整形、或阴道成型等手术就可以彻底解决了，这些手术只能说是普通手术。所以，如果你不幸有这种情况，不要害怕面对医生。
更少数的女性由于耻骨解剖学上的变异，耻骨边缘锐利，在特定的性交体位时会出现性交疼痛。此时，就要避免进行这种体位性交了。